审计费用应计入事业单位的管理费用科目中。在会计核算中，审计费用是事业单位为保证财务报告的真实、准确和完整而支付的费用，属于管理费用的一种。因此，在编制事业单位的财务报告时，应将审计费用计入管理费用科目中，并在财务报告中明细披露。同时，在税务上，审计费用可以作为企业所得税的扣除项目，可以减少企业所得税的税负。

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